Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms