Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms