Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms