Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRG1Q02297 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms