Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms