Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms