Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms