Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRB1P82279 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRB1P82279 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB1P82279 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB1P82279 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms