Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIM1P81133 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms