Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms