Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP3P54852 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms