Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A2P52657 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms