Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms