Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms