Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTRNP46939 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTRNP46939 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTRNP46939 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTRNP46939 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTRNP46939 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms