Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms