Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms