Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms