Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2P22307 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms