Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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