Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms