Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms