Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms