Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms