Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms