Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EDIL3O43854 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EDIL3O43854 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms