Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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