Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms