Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms