Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms