Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms