Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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