Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms