Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP3K4Q9Y6R4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms