Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms