Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms