Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms