Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA1Q9UND3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms