Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms