Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms