Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms