Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms