Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP9Q99956 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms