Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms