Protein–RNA interactions for Protein: Q99593

TBX5, T-box transcription factor TBX5, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX5Q99593 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBX5Q99593 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms