Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms