Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms