Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE2Q96FN4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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