Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TM4SF18Q96CE8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms