Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD1Q969G9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms